Ключова разлика - AFLP срещу RFLP

ДНК изследванията имат огромно значение за разбирането и определянето на филогенетични връзки, диагностицирането на генетични заболявания и картографирането на геномите на организма. Няколко техники, свързани с ДНК анализ, също се използват за идентифициране на определен ген или ДНК последователност в пул с неизвестна ДНК. Те са известни като молекулярни маркери. Полиморфизъм с дължина на усилен фрагмент (AFLP) и полиморфизъм с дължина на ограничения фрагмент (RFLP) са два такива молекулярни маркера (методи), разработени в молекулярната биология за откриване на генетична промяна между организмите. И двата метода са еднакво важни и имат предимства и недостатъци. Ключовата разлика между AFLP и RFLP е, че AFLP включва селективно PCR амплифициране на смиланата ДНК, докато RFLP не включва селективно PCR амплифициране на ДНК фрагментите.

СЪДЪРЖАНИЕ 1. Преглед и ключова разлика 2. Какво е AFLP 3. Какво е RFLP 4. Паралелно сравнение - AFLP срещу RFLP 5. Обобщение

Какво е AFLP?

AFLP (Полиморфизъм с дължина на усилен фрагмент) е важен инструмент в молекулярната биология и се използва широко в анализа на генетичните вариации. AFLP се основава на специфичното PCR амплифициране на фрагментираната геномна ДНК и откриване на полиморфизма чрез авторадиографи чрез гел електрофореза. AFLP допринася широко за идентифициране на генетични различия в щамове или тясно свързани видове от различни царства, включително растения, животни, бактерии и гъби. AFLP може да се извърши с малки количества неизвестни ДНК проби. Не изисква предварително познаване на последователността и проектиране на сонди.

Стъпки на AFLP


  1. Изолиране на ДНК Разграждането на ДНК с рестрикционни ендонуклеази Лигиране на ограничените фрагменти на ДНК с адаптери Селективно амплифициране на фрагментите със специфични рестрикционни места Разделяне на PCR продуктите чрез гел електрофореза Визуализация на гел матрицата с авторадиограф

AFLP е по-чувствителен и възпроизводим метод, който може да се използва при ДНК профилиране на няколко таксони, включително гъби, бактерии, растения и животни без предварително познаване на ДНК последователности. Той помага да се идентифицират леки разлики между индивидите в популациите поради силно чувствителния им характер. AFLP е важен и за картографиране на геноми, криминалистични изследвания, родителски тестове, генотипизиране и др.

Какво е RFLP?

Полиморфизмите с дължина на рестрикционния фрагмент (RFLPs) са техника, която се използва за откриване на генетичните вариации в хомоложните ДНК последователности. Това е първият метод, разработен за ДНК профилиране. Организмите имат уникални ДНК отпечатъци или ДНК профили. RFLP служи като важен инструмент за анализ на вариацията между ДНК профилите на интраспецифични или тясно свързани организми, тъй като хомоложните секвенции имат различни места (места) на рестрикция, които са уникални за определен организъм. Когато хомоложната ДНК се усвои със специфични рестрикционни ендонуклеази, това ще доведе до различни ДНК профили, които са уникални за всеки индивид. Следователно, главното в този метод е откриването на генетична промяна сред организмите чрез ограничаване на хомоложна ДНК със специфични рестрикционни ензими и анализ на полиморфизма на дължината на фрагмента чрез гел електрофореза и блотиране. Моделите на петна са уникални за всеки организъм и характеризират специфичните генотипове.

Стъпки на RFLP

  1. Изолиране на достатъчно количество ДНК от проби Фрагментация на ДНК пробите със специфични рестрикционни ендонуклеази в къса последователност Разделяне на получените фрагменти с различна дължина чрез агарозна гел електрофореза. Прехвърляне на геловия профил в мембрана чрез Южно блотиране Хибридизация на мембраната с белязани сонди и анализ на полиморфизма на дължината на фрагмента във всеки профил

RFLP е много важна техника за откриване на наследяване на болестта и намиране на риска от появата на заболяването сред членовете на семейството. RFLP често се използва и при картографиране на геноми, идентифициране на престъпници в криминалистиката, тестване на бащинство и др. RFLP също има няколко ограничения. RFLP изисква предварително познаване на данните за последователността, за да се проектират сонди за хибридизация. Също така изисква изолиране на достатъчно количество ДНК от пробата за анализ, което е трудно при съдебномедицински изследвания.

Каква е разликата между AFLP и RFLP?

Обобщение - AFLP срещу RFLP

AFLP и RFLP са две техники, използвани като генетични маркери за оценка на разнообразието и оценка на генетичните връзки в молекулярната биология. AFLP служи като ефективен и чувствителен метод за откриване на генетичен полиморфизъм между организмите, отколкото RFLP. Въпреки че и двата метода имат различна ефективност при откриване на генетични изменения, те все още се използват за отпечатване на ДНК и диагностициране на заболяването.

Справка: `1. Гарсия, Антонио АФ, Лучана Л. Бенхимол, Антония М. М. Барбоса, Исаас О. Джералди, Соуза-младши Клаудио Л. и Анете П. Де Суза. „Сравнение на маркери за RAPD, RFLP, AFLP и SSR за проучвания на разнообразието в инбридни линии от тропическа царевица.“ Генетика и молекулярна биология. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 март 2017 г. 2. „Полиморфизъм с дължина на ограничения фрагмент (RFLP).“ Национален център за информация за биотехнологиите. Национална медицинска библиотека на САЩ, и уеб. 19 март 2017 г. 3. Masiga DK и Turner CM (2004). „Амплифициран (рестрикционен) фрагмент с дължина на полиморфизма (AFLP)“. Методи Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 март 2017г

С любезност на изображенията: 1. „ALFP“ от Барбароса от Холандска Уикипедия - Прехвърлен от nl.wikipedia в Commons. (Public Domain) през Commons Wikimedia 2. „RFLP картографиране“ от Retama - Собствена работа (GFDL) чрез Commons Wikimedia